تضم الجامعة 11 كليات خاصة، وهم كلية الصيدلة والتصنيع الدوائى، وكلية طب الأسنان، وكلية الهندسة، بجانب كلية العلوم المالية والإدارية، وكلية اللغات والترجمة، وكلية الدراسات القانونية والمعاملات الدولية، بجانب كلية السياحة وإدارة الفنادق، وكلية العلوم الطبية المساعدة، وكلية الإعلام وفنون الاتصال، وكلية العلاج الطبيعى، وكلية الفنون والتصميم.
وتقبل جامعة فاروس بالإسكندرية التحاق جميع الطلاب المصريين والوافدين من حملة شهادة الثانوية العامة المصرية أو ما يعادلها من شهادات معتمدة من المجلس الأعلى للجامعات، وتقبل أيضًا فئات أخرى بشرط استيفاء الشروط التى يحددها مكتب القبول للجامعات الخاصة والأهلية التابع لوزارة التعليم العالى بالجمهورية، وهم شهادات الثانوية العربية (جميع الشهادات العربية والأجنبية)".
وشملت مصروفات جامعة فاروس الخاصة "كلية الصيدلة 55 ألف جنيه، كلية طب الأسنان 53 ألف جنيه، كلية الهندسة 42 ألف جنيه، كلية علاج طبيعى 36 ألف جنيه، كلية علوم طبية 20 ألف جنيه، كلية علوم مالية وإدارية 28600 جنيه، كلية الدراسات القانونية والمعاملات الدولية 19 ألف جنيه".